Tanken om å opprette et bispedømme i Smaalenene (senere Østfold) ble lansert allerede i 1840-årene. Det daværende Oslo bispedømme var enormt, og biskopen hadde store problemer med å ha et effektivt tilsyn med det store stiftet. Derfor ble Oslo stift oppdelt: I 1863 ble Hamar og Agder opprettet som egne bispeseter. Som følge av økt befolkningsvekst i Oslo stift ble deretter Tunsberg bispedømme opprettet i 1948. En av ideene som ble vurdert var å legge Østfold til Tunsberg, men dette ble forlatt siden det var vanskelig å holde et slikt bispedømme geografisk samlet.
I 1960-årene kom delingen av Oslo bispedømme – som nå bestod av Oslo, Akershus og Østfold - nok en gang opp. Også denne gangen var utfordringen at bispedømmet var for stort. I 1966 oppnevnte departementet et utvalg som skulle vurdere kirkens administrative grenser. Ett av forslagene var at det ble opprettet et nytt bispedømme bestående av Østfold og Akershus, med unntak av Asker og Bærum kommuner. Dette fikk ble støttet av daværende Oslo-biskop, Johannes Smemo.
Etter at det offentlige utvalget hadde anbefalt opprettelsen av et nytt Borg bispedømme, engasjerte flere kommuner i Østfold seg aktivt for å være vertskap for det nye bispesetet. Både Moss, Eidsberg, Sarpsborg og Fredrikstad mente det var gode historiske og aktuelle grunner til at bispesetet burde legges der. Et flertall i Oslo bispedømmeråd anbefalte at Fredrikstad ble stiftsby, noe som også departementet sluttet seg til.
Opprettelsen av Borg bispedømme med Fredrikstad som stiftsby ble vedtatt i Odelstinget 5.april 1968, med virkning fra 1.april 1969. Sommeren 1968 ble Bjarne Aasgt 7 anskaffet som bispebolig, og 13.desember ble den 40-år gamle domprosten i Bergen, Per Lønning, utnevnt til Borg bispedømme sin første biskop.
3.januar var Lønning, sammen med kona Ingunn og de fire barna deres, på den første befaringen i bispegården. Det skulle bli starten på drøyt seks aktive og innholdsrike år, inntil Lønning gikk av som biskop i Borg i 1975 i protest mot abortloven.
Kilde: Arne Bugge Amundsen: «Borg bispedømme 25 år – et historisk-kritisk skissebrett», i «Vår faste Borg – Borg bispedømme 25 år», 1994.